وتعد الوظائف الأساسية للأمعاء الغليظة هي:
- تكوين وإخراج البراز
- امتصاص الماء والأملاح المعدنية
- تعمل البكتيريا المفيدة التي توجد في القولون على إفراز فيتامين b1 وb2 وb12 و k. وتعمل أيضًا على منع نمو البكتيريا الضارة.

تفرز خلايا القولون مادة مخاطية لحماية جداره وجعله زلقًا. ويتسبب التهاب جدار الأمعاء في إفراز كميات كبيرة من المخاط فضلاً عن الماء والسوائل التي تتحلل بالكهرباء، وفى هذه الحالة تتم رؤية المخاط في البراز وقد يؤدى ذلك إلى الإسهال.
على الصعيد الآخر، إذا بقي البراز في القولون لمدة أطول من اللازم يحدث الإمساك، ويعاد امتصاص كمية كبيرة من السموم إلى مجرى الدم مرة أخرى. وتسمى هذه العملية التسمم الذاتي.